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全球首个全原子生成类药寡聚体!复融生物 × 力文所:达成首批设计交付 | 项目进展

全球首个全原子生成类药寡聚体!复融生物 × 力文所:达成首批设计交付 | 项目进展

近日,复融生物与力文所在创新大分子底层设计领域的联合攻坚取得实质性突破。 依托力文所自主研发的Pallatom2 全原子扩散生成模型双方联合推进的「类药性寡聚体(Drug-like Oligomers)」从头设计项目已正式完成首批里程碑式交付。

这也是全球首个全原子生成的类药性寡聚体设计,在研发层面实现的首次阶段性交付。

这批由 Pallatom2 引擎精准“绘制”的寡聚体分子,在复融生物的高通量实验平台中展现了卓越的物理特性。实验证实,目标分子在组装构象、热稳定性及成药性指标上展现出领跑行业的产业化潜力。这不仅是一次单纯的模型能力验证,更是Pallatom2 引擎全面赋能医药产业、彻底打通“AI生成-工业级交付”闭环的有力证明。

作为专注于创新大分子药物研发的生物技术企业,复融生物始终致力于以AI技术和工程化思维突破传统药物开发的效率边界。公司前瞻性布局"干湿实验"的双轮驱动体系,构建了从分子设计到PCC的完整早期研发闭环。此次与力文所的联合攻关,正是这一战略的重要实践——复融生物凭借大分子AI智能发现平台和成熟的高通量表达、纯化与表征平台,为AI生成的复杂分子提供了从数字模型到实体分子的关键转化通道,打通了"计算设计-工业验证-成药性评价"的创新链条

01 挺进深水区:为什么「类药性寡聚体」是计算设计的极限挑战?

在现代生物药研发中,通过构建寡聚体来实现高阶多价性或受体聚集,是激活凋亡通路或突破传统单抗疗效天花板的重要路径。然而,将寡聚体概念转化为具备“类药性”的工业级分子,面临着极高的工程学壁垒:

  • 几何精度的“蝴蝶效应”:寡聚体依赖严苛的对称性构建。在这种架构下,单体界面哪怕只有 0.5 埃的微小偏差,在经过对称轴旋转放大后,都会在复合物边缘导致数个埃的错位。这种几何误差会导致分子无法“闭合”,产生巨大的物理内应力,使分子像绷紧的弹簧一样在溶剂中瞬间失稳解体。

  • 药学属性的“负向对冲”:类药性要求分子在实现皮摩尔级超强亲和力的同时,必须保持极高的溶解度和均一性。然而,强结合通常依赖疏水相互作用,这与溶解度天然对冲。如何在强疏水的组装界面与高度溶剂化的分子表面之间找到那个极其狭窄的平衡点,是设计中的地狱难度。

  • 多维约束的协同求解:一个合格的候选分子必须同时满足稳定性、特异性、产率和低免疫原性。在涉及数万个原子的复杂体系中,这些维度高度耦合且互相牵制。传统的“分步走”策略(先定骨架、后配序列)往往顾此失彼,导致设计方案在实验阶段大面积折损。

02 范式降维:Pallatom2 如何定义“精准交付”?

面对类药性寡聚体设计的极限挑战,Pallatom2 彻底摒弃了传统方法的“拼接与修补”,凭借底层算法的重构,重塑了计算设计的逻辑基石:

  • 对称约束下的全局扩散:摒弃了“先单体后拼凑”的滞后流程。Pallatom2 在生成的初始阶段,就将对称性作为原生的物理约束嵌入扩散轨迹,确保了主链骨架在原子尺度上的几何闭合自洽

  • 全原子同步进化:不同于传统方法主、侧链解耦的设计,Pallatom2 实现了“生成即最优堆积”。模型在生成主链轨迹的同时,已同步完成了上千个侧链原子的热力学优化,从源头上消除了空间位阻。

  • 精准驱动成药性:针对类药性分子对溶解度和产率的严苛要求,Pallatom2 展现出了卓越的界面控制能力。实验数据显示,首批交付的分子在无需后期改造的情况下,即实现了预期的寡聚态分布。这种‘生成即达标’的设计能力,为解决复杂大分子的 CMC 壁垒提供了全新的确定性路径。

03 实验全面通关:确立工业级验证标杆

得益于计算架构的先进性,候选分子最终在复融生物的实验体系中得到了严谨的生物物理学验证。首批交付的候选分子在多项核心实验中表现卓越:

  • 组装态高度均一:实验证实候选分子成功实现了预期的寡聚化状态,在体积排阻色谱(SEC)中展现出极佳的单分散性,峰型单一且清晰。

  • 皮摩尔级超强亲和力:多个核心候选分子的亲和力达到了皮摩尔级别,实现了数倍的性能跨越。

  • 卓越的理化稳定性与产率:目标分子在热稳定性及表达滴度等指标上均达到工业评价标准,部分明星分子已直接具备推进成药性评价的基础。

04 终局视野:从“大海捞针”到“按需定制”

这次交付的深层意义,在于宣告了大分子药物开发范式的彻底颠覆。

过去,新药研发本质上是在“自然界的武器库”里发现有用的分子,然后进行微调。而力文所与复融生物的合作证明了:我们现在可以跳出盲目试错的环节,根据疾病的临床需求(如:需要多强的亲和力、需要怎样的多价效应),直接逆向求解出自然界原本不存在的原子排列方式。

当 AI 能够精确操控原子级别的组装时,生物医药就不再是一门重度依赖“碰运气”的实验学科,而是正在向精密工程学全面靠拢。Pallatom2 就像是一台高精度的“原子打印机”,它缩短的不仅仅是研发的物理时间,更是人类跨越自然进化亿万年限制的鸿沟。

结语:

定义计算分子的新纪元。本次阶段性交付是 AI 真正接管大分子底层设计“方向盘”的开端。当"全原子生成"成为产业的底层基础设施,大分子药物开发将彻底挣脱"自然界既有边界"的束缚——能走多远,将取决于人类的想象力能抵达哪里。

一场从 Bits Atoms的跨越,已然开启。


关于复融生物

复融生物是一家临床阶段的生物制药公司,致力于为存在严重未满足临床需求的患者开发变革性细胞因子疗法。公司已建立起四个专有的合成免疫学技术平台:Fbody®长效化技术平台、Fc工程化平台、Syntokine®新型人工合成细胞因子平台以及大分子AI智能发现平台。其首发管线FL115是一款具有“同类最佳”潜力的白细胞介素-15IL-15)超级激动剂,目前正推进与PD-(L)1抗体联用治疗晚期实体瘤的I期临床,以及与卡介苗(BCG)联用治疗NMIBCII期临床。公司的第二款候选药物FL116,是一种抗PD-1抗体与IL-18突变体融合而成的抗体融合蛋白,该工程化的IL-18突变体仅与IL-18结合,不与IL-18BPIL-18结合蛋白)结合,已在多种对免疫检查点抑制剂耐药的体内肿瘤模型中显示出强大的肿瘤杀伤能力。